Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms