Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX6P78412 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX6P78412 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX6P78412 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX6P78412 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX6P78412 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX6P78412 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX6P78412 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX6P78412 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX6P78412 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX6P78412 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX6P78412 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX6P78412 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX6P78412 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms