Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPNP63162 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms