Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFRA1P56159 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms