Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP3M2P53677 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms