Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LIMK2P53671 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIMK2P53671 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIMK2P53671 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIMK2P53671 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIMK2P53671 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LIMK2P53671 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms