Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MVDP53602 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MVDP53602 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MVDP53602 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MVDP53602 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms