Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms