Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLCP48506 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLCP48506 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLCP48506 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLCP48506 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCLCP48506 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCLCP48506 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCLCP48506 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCLCP48506 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCLCP48506 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms