Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ME1P48163 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ME1P48163 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ME1P48163 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ME1P48163 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ME1P48163 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms