Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms