Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms