Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN7P35236 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms