Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 ZNF506-203ENST00000540806 1424 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LIAS-201ENST00000261434 1258 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 BCL2L15-202ENST00000393316 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AP001021.2-201ENST00000577935 544 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AP005482.3-201ENST00000585877 720 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD11P31277 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC00159-202ENST00000414877 428 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC100843.2-201ENST00000589084 324 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD11P31277 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms