Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC13P31276 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC13P31276 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms