Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5DP30049 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5DP30049 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms