Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms