Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMBRP28336 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMBRP28336 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMBRP28336 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMBRP28336 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NMBRP28336 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NMBRP28336 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NMBRP28336 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMBRP28336 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMBRP28336 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms