Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXP28300 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXP28300 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXP28300 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXP28300 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXP28300 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXP28300 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXP28300 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXP28300 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms