Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCD3P28288 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms