Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR2AP28223 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms