Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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