Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USF1P22415 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USF1P22415 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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USF1P22415 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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USF1P22415 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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USF1P22415 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USF1P22415 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USF1P22415 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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