Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4AP20338 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4AP20338 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms