Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDSP20132 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDSP20132 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDSP20132 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDSP20132 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDSP20132 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDSP20132 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDSP20132 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDSP20132 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDSP20132 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDSP20132 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDSP20132 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms