Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC9A1P19634 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms