Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD53P19397 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD53P19397 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms