Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR1P18146 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR1P18146 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR1P18146 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EGR1P18146 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms