Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTRB1P17538 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CTRB1P17538 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CTRB1P17538 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CTRB1P17538 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CTRB1P17538 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CTRB1P17538 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CTRB1P17538 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CTRB1P17538 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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CTRB1P17538 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTRB1P17538 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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