Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DSPP15924 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSPP15924 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSPP15924 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSPP15924 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DSPP15924 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSPP15924 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSPP15924 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DSPP15924 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSPP15924 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSPP15924 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSPP15924 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms