Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms