Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3P10147 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3P10147 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3P10147 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3P10147 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3P10147 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3P10147 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3P10147 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3P10147 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms