Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PKHD1P08F94 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PKHD1P08F94 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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PKHD1P08F94 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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