Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPM2P07951 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TPM2P07951 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPM2P07951 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPM2P07951 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPM2P07951 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPM2P07951 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPM2P07951 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPM2P07951 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPM2P07951 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPM2P07951 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms