Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUDT3O95989 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NUDT3O95989 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUDT3O95989 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms