Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG12O94817 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG12O94817 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms