Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms