Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA4O75676 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms