Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMPCBO75439 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms