Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5O75197 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5O75197 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP5O75197 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP5O75197 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP5O75197 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP5O75197 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP5O75197 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5O75197 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms