Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PPFIA3O75145 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PPFIA3O75145 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms