Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNSO60931 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms