Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GMDSO60547 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GMDSO60547 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GMDSO60547 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GMDSO60547 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GMDSO60547 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GMDSO60547 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GMDSO60547 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GMDSO60547 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GMDSO60547 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms