Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA0556O60303 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KIAA0556O60303 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KIAA0556O60303 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KIAA0556O60303 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms