Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKNO60260 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKNO60260 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKNO60260 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKNO60260 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKNO60260 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms