Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC28A2O43868 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms