Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRTM2O43300 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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