Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNMO15061 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNMO15061 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNMO15061 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNMO15061 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNMO15061 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms