Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD1AO15047 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms