Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms